Boca del Medio
Esta zona ofrece un buceo de gran calidad, pero que en pocas ocasiones es posible realizar, ya que la vertiente este es la que recibe los vientos más fuertes procedentes de aguas del Atlántico. Si la suerte y los vientos acompañan, podremos ver grandes corales duros y blandos, gorgonias y una variada muestra de los peces más representativos de estas latitudes. También es posible explorar los restos de algún naufragio, pero en realidad los envites del mar los han desmantelado, quedando chapas, algo de la estructura y grandes anclas.

Cote
En el centro de la costa sur, entre Cayo Sal y Maceta de Nube Verde, la Boca de Cote es una de las salidas naturales de la laguna de Los Roques. La inmersión se desarrolla en una ladera pronunciada, que comienza a poca profundidad y que se prolonga hasta cotas superiores a los 30 metros, para encontrarse con el fondo arenoso. En el fondo podremos ver rayas americanas y en ocasiones águilas marinas moteadas rastreando en la arena, aunque estas últimas es más frecuente verlas cruzar por el azul. En el arrecife, barracudas, meros, peces ardilla, loros y peces lima.

Dos Mosquises  
Punto de buceo situado al oeste del archipiélago y lugar donde se encuentra la estación de investigación científica. El arrecife es muy colorido y es el lugar perfecto para localizar tortugas. En este arrecife, fundamentalmente en el mes de Junio, suelen verse pequeños tiburones que acuden a estos fondos para aparearse. Esta inmersión puede ser algo profunda.

Francisqui
Un punto perfecto para los más inexpertos o como inmersión de chequeo. Se encuentra muy cerca del Gran Roque, lo que hace que también sea visitado para hacer snorkeling. El recorrido se realiza alrededor de pequeños islotes, sin superar los 14 m. de profundidad, y en la zona abundan tanto corales duros como blandos. La fauna vertebrada es la típica de estos arrecifes coralinos, con pequeños meros, pargos, peces loro, peces ángel francés, langostas, morenas, peces mariposa y peces trompeta. También es posible encontrar barracudas solitarias, en las zonas de penumbra. 

La Ahogada
Una de las inmersiones que se realizan en el Gran Roque, al pie de los acantilados del extremo oeste, que se prolongan bajo el agua, hasta terminar en un fondo de arena. A lo largo de la pared rocosa, vale la pena prestar atención a las grandes grietas, ya que en su interior suelen habitar morenas y langostas, o simplemente encuentran protección meros y otros peces. En la zona de arena es casi seguro que veremos grandes rayas y posiblemente alguna tortuga.

La Buceadora 
Es una de las inmersiones más populares de Gran Roque. Se puede recorrer el arrecife o adentrase en la cueva, dependiendo de nuestra experiencia, En la cueva podemos alcanzar cúpulas con aire, y descubrir curiosas especies de crustáceos, en ocasiones diferentes a los que observamos en el arrecife. Los menos expertos, pueden limitarse a la entrada, disfrutando desde el interior de mágicos contraluces. 

La Guasa
Un punto con buceo algo complicado, que en ocasiones lo limita prácticamente a los buceadores de experiencia, pero sin duda alguna puede ser una de los buceos más interesantes. La inmersión se realiza en un bajo o montaña submarina, cuya cumbre se alcanza a los 8 metros de la superficie, descendiendo hasta los 37 metros. Si la corriente es fuerte, tendremos ocasión de ver mucha actividad, con cardúmenes de júreles, barracudas y grandes meros, que acuden en busca de alimento. Si la suerte acompaña en ocasiones entra algún tiburón. 

La Pelona
Un gran cayo arenoso, cuyo arrecife de coral posee grandes masas de coral pétreo que, por sus dimensiones, pueden tener cientos de años. Es una zona de visibilidad media, como consecuencia de la gran concentración de nutrientes, pero por esa razón la vida es muy prolífica: loros, serránidos, peces ángel, lábridos, peces lima, jureles, pargos, langostas, etc.

Los Sábalos
Cueva rocosa que se sitúa al pie de los acantilados del norte del Gran Roque. Como su propio nombre indica, uno de los grandes atractivos de la inmersión son los sábalos o tarpones, de cuerpo plateado y robusto, estos depredadores suelen permanecer durante el día en zonas más oscuras, mostrando toda su actividad como cazador en la noche. Por la zona también veremos peces loro, gramátidos, meros de diferentes especies y peces ángel. 

Madrizqui
Un buen punto, tanto para el buceo diurno como nocturno. El paisaje está dominado por los corales duros, tanto de cerebro como asta de alce, aunque las gorgonias y corales blandos también tienen una buena representación, al igual que las esponjas, fundamentalmente las de barril. Los peces que frecuentas estos fondos, son en su mayoría de talla mediana y pequeña, pero con una gran variedad, como los dragoncillos que podremos encontrar en las anémonas. Un estupendo lugar para localizar pequeños invertebrados.

Noronqui
Plataforma coralina, dominada por los corales duros más típicos del sur del Caribe. Junto a estos podremos localizar gran cantidad de peces, tales como roncadores o  peces cerdo. También veremos cirujanos y peces lagarto. Es un buen lugar para buscar invertebrados y vida pequeña.

Punta Cayo Sal
Esta inmersión se localiza en el extremo oeste de Cayo Sal, que es la larga isla que forma la barrera sur. El buceo se realiza en una pared, de entre 20 m. y 45 m. de profundidad, a lo largo de la cual encontraremos pequeñas cavernas, en la cota de 30 a 35 m. En ocasiones una suave corriente acompaña a los buceadores, mientras contemplan grandes meros, pargos, peces loro, peces ángel o tortugas. Una atenta mirada a las aguas abiertas nos permitirá descubrir el paso de águilas marinas moteadas.

Rebusqui
Un lugar cercano al Gran Roque. La formación coralina ha adquirido una forma envolvente, por la que recibe el nombre de “La Solapa de Rebusqui”. La visibilidad suele ser muy aceptable y es un lugar perfecto para localizar tortugas y tarpones, e incluso en ocasiones tiburones.